Чего ждать?
На этот вопрос ответить невозможно. Ожидать можно чего угодно. Как освобождения от армии с присвоением категории "В", так и призыва с категорией "Б". Гадать смысла не имеет.
Идите на медкомиссию, предоставляйте документы, можете сказать о том, что в военное училище Вас не взяли. Но нужно понимать, что медкомиссия в военном училище работает в условиях избытка желающих поступить, а медкомиссия в военкомат в условиях недобора призывников.
Если Вашего сына признают годным к службе, можете обжаловать это решение, вначале в областной военкомат. Основания для этого у Вас есть. И категорию "В" Вы можете отстаивать.