Здравствуйте.
Отсрочка от призыва в армию на основании обучения в магистратуре, после получения высшего образования по программе бакалавриата предоставляется в соответствии с пп. «а» п. 2 ст. 24 N 53-ФЗ «О воинской обязанности и военной службе».
Согласно закону, право граждан на отсрочку в связи с обучением в магистратуре поставлено в зависимость от формы обучения - должна быть очной, наличия государственной аккредитации образовательной программы магистратуры, года получения высшего образования по программе бакалавриата и основания, по которому ранее была предоставлена отсрочка от призыва на военную службу.
Иных требований закон не содержит.
Право на отсрочку в связи с обучением в магистратуре не связано с исчезновением оснований, по которым была предоставлена первая отсрочка (в данном случае, первая отсрочка была предоставлена решением призывной комиссии на основании справки, установленной формы, свидетельствующей об обучении по программе бакалавриата).
Иными словами, за Вами сохраняется право на отсрочку от призыва в армию в связи с обучением в магистратуре.
...мне выдадут отсрочку или возникнут с этим проблемы?
На практике, могут быть проблемы с получением отсрочки. Главное, если Вас вызывают в военкомат, предоставьте все требуемые документы: копия диплома, справка установленной формы из образовательной организации. При неблагоприятном развитии событий, первым делом, обращайтесь в вышестоящую призывную комиссию с жалобой. Если результат рассмотрения жалобы окажется неудовлетворительным, обращайтесь в суд с исковым заявлением.
выдержка из пп. «а» п. 2 ст. 24 N 53-ФЗ;
Предусмотренная настоящим подпунктом отсрочка от призыва на военную службу предоставляется гражданину только один раз, за исключением одного из случаев, если первая отсрочка от призыва на военную службу была предоставлена гражданину в соответствии с абзацем седьмым* настоящего подпункта, гражданин повторно может воспользоваться правом на отсрочку от призыва на военную службу в соответствии с абзацем девятым** настоящего подпункта.
...
Право на отсрочку от призыва на военную службу имеют граждане, обучающиеся по очной форме обучения в образовательных организациях и научных организациях по имеющим государственную аккредитацию:
...
*(абзац седьмой)
программам бакалавриата, если указанные обучающиеся не имеют диплома бакалавра, диплома специалиста или диплома магистра, - в период освоения указанных образовательных программ, но не свыше установленных федеральными государственными образовательными стандартами, образовательными стандартами сроков получения высшего образования по программам бакалавриата;
...
**(абзац девятый)
программам магистратуры, если указанные обучающиеся не имеют диплома специалиста или диплома магистра и поступили на обучение по программам магистратуры в год получения высшего образования по программам бакалавриата, - в период освоения указанных образовательных программ, но не свыше установленных федеральными государственными образовательными стандартами, образовательными стандартами сроков получения высшего образования по программам магистратуры.